Die Fachhochschule Biberach ging 1971 aus der 1964 gegründeten staatlichen Ingenieurschule für Bauwesen in Biberach hervor. Die dort zuerst angebotenen Studiengäng waren Architektur und Bauingenieurwesen. 1978 folgte der Studiengang Betriebswirtschaft (Bau und Immobilien), welcher so erstmals in Deutschland angeboten wurde. 1991 wurde im Rahmen des Programms - FH 2000 - der Studiengang Bauingenieurwesen/Projektmanagement eingeführt. 1998 folgte der Studiengang "Gebäudetechnik/Gebäudeklimatik". 2001 wurde der Masterstudiengang 'Architektur-Entwurf' eingeführt. Die Fachbereiche Architektur und Bauingenieurwesen nehmen mit zwei Lehreinheiten die Lehrgebiete "Bauen und Planen mit Holz" sowie "Konstruktiver Holzbau" auf. Beide Lehreinheiten gründen ein gemeinsames "Holzbauinstitut" an der Fachhochschule. Zum Wintersemester 2006/2007 wurde der bis dato deutschlandweit einzigartige Bachelorstudiengang "Pharmazeutische Biotechnologie", mit dem die Hochschule Biberach auch fachlich Neuland betritt, zum Sommersemester 2008 der Studiengang "Energiesysteme" eingerichtet. Des weiteren wurde die Einführung des Studiengangs "Bioprozesstechnik", sowie eines Masterstudiengangs "Pharmazeutische Biotechnologie" beschlossen.